Die Kiefer stellt mit etwa 70 % die Hauptbaumart im Naturpark dar. Die Bestände sind als gleichaltrige Reinbestände aus Pflanzungen hervorgegangen. Mit weniger als 10 % sind Roterle, Stiel- und Traubeneiche, Birke, Robinie, Aspe und Lärche vertreten. Mit deutlich geringeren Anteilen kommen Esche, Fichte, Douglasie, Hainbuche, Roteiche, Bergahorn, Spitzahorn, Vogelkirsche, Ulme, Hybridpappelarten und Weidenarten vor.
Naturschutzfachlich wertvolle Waldbiotoptypen sind in folgenden Gebieten vertreten:
Flechten-Kiefernwälder
Bestände, die neben der Gemeinen Kiefer lediglich Flechten der Gattung Cladonia und Cornicularia und nur äußerst wenige andere höhere Pflanzen aufweisen, beschränken sich auf extrem arme, trockene Standorte. Bemerkenswert ist oft die Pilzflora dieser Gebiete mit einer Reihe von rückläufigen Mykorrhiza-Arten der Kiefer, wie Rosa-Schmierling und Habichtspilz. Vorkommen: Seddiner Heidemoore und Düne, Glauer Berge, Vorderer Löwendorfer Berg, Kemnitzer Heide, Düne bei Niebel.
Erlen-Bruchwäler: stocken auf meso- bis eutrophen organischen Nassböden mit hoch anstehendem, stagnierendem oder langsam sickerndem Wasser und kommen in fast allen Teilgebieten des Naturparks vor.
Eichen- Hainbuchenwälder stocken auf Böden mit Grundwassereinfluss, der nicht ausreicht, dass es zur Ausbildung von Auenwäldern kommt. Sie sind häufig aus früheren Nieder-, Mittel- oder Hudewäldern hervorgegangen. Im Naturpark sind Bestände im Siethener Elsbruch, Felgentreuer Busch, Zarth, Oberes Nieplitztal, Nuthetal bei Forst Zinna, Stadtpark Treuenbrietzen zu finden.
In Eichenmischwälder bodensaurer Standorte kommt die Stiel-Eiche vor, an trockeneren Standorten stockt auch Trauben-Eiche. Diesen ist Hänge-Birke und in kontinental beeinflussten Landschaften auch Wald-Kiefer beigesellt. Vorkommen: Saarmunder Berg, Siethener Elsbruch, nördlich Gröben, Glauer Berge, Saarmunder Elsbruch, Schäferluch, Seeluch, Felgentreuer Busch, Obere Nieplitztal.
Rotbuchenwald existier nur als größerer Bestand am Poschfenn und ist höchst wahrscheinlich forstlich begründet.